李永辉工程师作药苑讲座——活性分子的分子动力学的超算解决方案与GROMACS应用
2023年4月6日下午,国家超级计算成都中心计算化学工程师李永辉应药学院/现代中药产业学院、临床中药系和中医脑病研究所邀请,做了 “活性分子的分子动力学的超算解决方案与GROMACS应用 ”的专题讲座,讲座由临床中药系系主任、中医脑病研究所所长徐世军教授主持。
李永辉工程师从理论化学计算基础、研究针对的问题、GROMACS软件介绍和成都超算中心使用GROMACS情况进行简要介绍。并以鸡蛋白溶菌酶在水溶液中的分子动力学模拟为例进行了计算思路、操作与可能问题的详细介绍,并对各种生物膜结构的搭建与模拟介绍了一些操作经验。
讲座后,针对到场师生提出的关于预测化合物转运能力及与蛋白结合构象转变等中医药研究问题,李永辉工程师结合自身经验进行了解答,进一步加深了与会师生对分子动力学模拟的理解。分子动力学作为成熟的计算工具,可为药剂学、药理学和药物化学等相关研究提供低成本、高准确度的预测。本次讲座帮助到场师生开阔了研究视野、拓展了科研思路,为学院今后的科研工作带来了新的思考。
(文/苏琴 图/徐世军、邓晶晶)
终审:药学院科学研究管理员